Як супервычисления допомагають генетики

Здатність Windows Azure обробляти величезні обсяги даних знадобилася і в дослідженні людського геному.

Нещодавно вчені застосували хмарний сервіс від Microsoft для обробки величезних масивів інформації про генетичних маркерах, які відповідають за хвороби. За допомогою отриманих даних учені зможуть краще боротися з ішемічною хворобою серця, гіпертонії, запальні захворювання кишечнику (хвороба Крона), ревматоїдний артрит, а також першої та другої стадією діабету.

Дослідження в цій області досить складні, оскільки доводиться працювати з великою кількістю даних. Однак фахівці Асоціації дослідження генома (GWAS) і дослідницької групи eScience в Microsoft Research розробили новий алгоритм під назвою FaST-LMM, який значно полегшила процес. Завдяки цьому стало можливим знайти нові генетичні зв'язку з хворобами шляхом аналізу наборів даних, які на кілька порядків більше, ніж були раніше. Це також дозволить виявити і більш тонкі сигнали в масиві даних.

В рамках дослідження населення Великобританії дослідники проаналізували 63,524,915,020 пар генетичних маркерів. За 72 години хмарний сервіс використав близько 27 тисяч комп'ютерів. Всього було виконано близько мільйона завдань, що еквівалентно 1,9 млн годин обчислень. Один восьмиядерний сервер робив би це близько 25 років.

В результаті вчені змогли відкрити для себе нові зв'язки між геном і вищевказаними захворюваннями, що може допомогти зробити потенційний прорив в їх профілактики і лікування.

Windows Azure робить подібні обчислювальні потужності доступними для кожного. Крім того, дослідники в цій області можуть і самостійно перевірити ці дані у своїх лабораторіях - алгоритм FaST-LMM доступний на вимогу в Windows Azure Marketplace.